অটোইমিউন (ত্রুটিপুর্ণ রোগ প্রতিরোধ ব্যবস্থা) ডিজিজের কারণে চুল পড়ে যেতে পারে। ইমিউন সিস্টেমের কাজ হচ্ছে পরিবেশ হতে যেসব জীবাণু দেহের ভিতরে প্রবেশ করে তা হতে সুরক্ষা প্রদান করা। যখন এই সিস্টেম লোমগ্রন্থির সুস্থ টিস্যুকে আক্রমণ করে তখন এই সমস্যা দেখা দেয়। এই সমস্যার ক্ষেত্রে চুল পড়ে যাওয়া ছাড়া আর অন্য কোনো ধরনের লক্ষণ প্রকাশ পায় না।

১৪% রোগীর যে স্থান হতে চুল পড়ে যায় সে স্থানে জ্বালাপোড়া করে এবং চুলকায়। চুল পড়ে যাওয়ার প্রক্রিয়াটি নির্দিষ্ট নয় এবং বেশিরভাগ রোগীর দেহের যেকোনো একটি নির্দিষ্ট অংশ থেকে চুল পড়ে। মাথার ত্বকে এই সমস্যা বেশি দেখা যায়। একে দুইভাগে ভাগ করা যায়- (১) অ্যালোপেসিয়া টোটালিস (Alopecia totalis):  যখন  শুধু মাথার চুল পড়ে যায়  (২) অ্যালোপেসিয়া ইউনিভার্সালিস (Alopecia universalis): যখন দেহের সমস্ত লোম পড়ে যায়। এই রোগের প্রকৃত কারণ এখনো জানা যায়নি, তবে এর পেছনে বংশ বা জিনগত কারণ থাকতে পারে।

কি কারণে চুল পড়ে যাচ্ছে তার উপর এই সমস্যার  চিকিৎসা নির্ভর করে।  এছাড়াও মেডিসিন ও হেয়ার রিস্টোরেশনের সাহায্যে এই সমস্যা থেকে মুক্তি পাওয়া সম্ভব।